Отношения с Азербайджаном в контексте Восточного партнерства строятся согласно двум главным принципам:
Заключенный в 2006 году Договор о стратегическом партнерстве в сфере энергетики до сих пор выглядит отличным примером взаимовыгодного сотрудничества. Однако двусторонние отношения охватывают не только сектор энергетики, но и другие сферы деятельности; важные шаги необходимо предпринять в области демократии и основных свобод.
Евросоюз готовится к более плотному взаимодействию с Азербайджаном. В 2010 году начаты переговоры о заключении конкретного договора об ассоциации.
Эстония и Азербайджан
Отношения Эстонии и Азербайджана хорошие, в последние годы становятся все более интенсивными. Обе страны заинтересованы в дальнейшем развитии экономических и политических связей. Одним из главных направлений внешней политики Азербайджана в последние годы было плотное сотрудничество с Европой и евроатлантическими структурами. Эстония поддержала вступление Азербайджана в Совет Европы — Азербайджан подал заявку в 1996 году, когда Эстония была председателем Совета. В январе 2001 года Азербайджан стал полномочным членом Совета Европы. Эстония также поддерживает сближение Азербайджана с евроатлантическими структурами и Евросоюзом.
ЭЦВП в рамках двустороннего и многостороннего сотрудничества организовывал семинары и ознакомительные поездки в Эстонию для государственных чиновников Азербайджана, в последнее время мероприятия были посвящены вопросам государственной службы и э-государства.